國史館為提供國史研究論文之發表園地，促進學術成果交流，特發行《國史館館刊》，收錄與中華民國史、臺灣史相關之學術論文、研究討論、研究概況及書評。本刊最早可溯自1947年在南京創刊，1987年1月在臺復刊；2001年12月，為提升國史館學術研究水準，將復刊中之研究論文與書評另行刊載，出版《國史館學術集刊》，自第1期至第6期為半年刊，第7期改為季刊，迄2008年12月共達18期，為本館代表性之學術刊物。後為加強國史研究之傳統，自2009年3月起，復將《國史館學術集刊》改回原刊名《國史館館刊》，並接續期別，自第19期起繼續以學術季刊形式發行至今。2012年起，經科技部審查通過，收錄為「臺灣人文及社會科學期刊引文索引核心期刊」。
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